在PyCharm中，可以通过以下步骤设置Run窗口的显示方式：
- 打开PyCharm的设置：点击菜单栏中的"File"，然后选择"Settings"。
- 在设置窗口中，选择"Appearance & Behavior"，然后选择"Console"。
- 在右侧的"Console"选项卡中，可以进行以下设置：
- “Console Variables”：设置是否显示变量列表。
- “Redirect input from”：设置是否从文件中重定向输入。
- “Scroll to the end on output”：设置是否在有新输出时自动滚动到输出的末尾。
- “Keep console open on process termination”：设置是否在程序运行结束后保持Run窗口打开。
- “Use soft wraps in console”：设置是否在Run窗口中使用软换行。
- 完成设置后，点击"OK"按钮保存设置。
通过以上步骤，可以根据个人需要自定义Run窗口的显示方式。
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