在Spring Boot中配置双数据源可以按照以下步骤进行：
配置数据源：在application.properties或application.yml文件中配置两个数据源的连接信息。例如，配置两个数据源的连接URL、用户名和密码。
创建数据源Bean：在配置类中创建两个数据源的Bean，并使用@Bean注解将其注册到Spring容器中。
创建JdbcTemplate Bean：为每个数据源创建一个JdbcTemplate Bean，并分别注入对应的数据源。
创建事务管理器：为每个数据源创建一个事务管理器，并分别注入对应的数据源。
配置多数据源支持：在配置类中使用@Primary注解指定一个数据源作为默认数据源，并使用@ConfigurationProperties注解加载两个数据源的配置属性。
配置事务管理器：在配置类中使用@EnableTransactionManagement注解开启事务管理，并配置事务管理器。
配置Mapper扫描：在配置类中使用@MapperScan注解配置MyBatis的Mapper扫描路径。
在需要使用数据源的地方注入JdbcTemplate Bean，并使用对应的数据源操作数据库。
需要注意的是，双数据源配置需要使用到多个数据库连接信息，因此需要确保配置文件中的连接信息正确，并且在代码中使用对应的数据源进行操作。
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