要启动Tomcat时指定配置文件，可以通过以下步骤操作：
打开Tomcat的安装目录。
进入bin目录。
在命令行中输入以下命令（假设配置文件为conf/server.xml）：
云服务器
物理服务器
虚拟主机
跨境电商服务器catalina.bat run -config conf/server.xml
./catalina.sh run -config conf/server.xml
这将启动Tomcat并使用指定的配置文件。
请注意，上述命令中的run参数表示以调试模式启动Tomcat，如果不需要调试模式，请将其替换为start。
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